Состоит из пяти залов, каждый из которых отражает период развития рыбохозяйственных исследований на Дальнем Востоке и направления деятельности ТИНРО: центральный зал, зал южных морей, зал современных исследований ТИНРО, зал, посвященный исследованиям на Чукотке и исследованиям морских млекопитающих, зал промрыболовства.